Performance of numpy matrix vector product on scipy.stats.qmc.Sobol vector when changing reshaping order

I am trying to implement a Brownian bridge and want to speed up the path construction via numpy matrix multiplication, once the bridge is initialised. I am drawing data for 3 underlyings and 256 time steps for 2^16 different paths, which is achieved by drawing 2^16 Sobol’ numbers in 3*256 = 768 dimensions. I then reshape the drawn 2D array into the 3D array of shape (3, 256, 2^16) and apply the brownian bridge matrix of shape (256, 256) via numpy matrix multiplication. To use the first dimensions for the largest variance contributions in the brownian bridge, the array is reshaped using the order=’F’ keyword.

I have noticed that the numpy matrix product “@” is almost 100 times slower when it is applied to the ‘F’ order reshaped array instead of the default ‘C’ order reshaped array. This kills any performance gain I get from the numpy matrix multiplication.

Does anyone know why this happens? Is there a way around this?

The following snippet reproduces the issue. Running on my local machine, I get around 0.14 seconds for ‘C’ and 12.9 seconds for ‘F’.
I am running Python 3.9.13, scipy version 1.10.0, numpy version 1.23.4.

from timeit import default_timer
from scipy.stats.qmc import Sobol
import numpy as np


np_gen = np.random.default_rng(seed=42)
matrix = np_gen.random((256, 256))
sobol_gen = Sobol(3*256, bits=64, seed=42)
sobol_nbrs = sobol_gen.random_base2(16).T

sobol_c_reshape = sobol_nbrs.reshape((3, 256, 2 ** 16), order='C')
sobol_f_reshape = sobol_nbrs.reshape((3, 256, 2 ** 16), order='F')

def perf_measure(input_nbrs):
    start = default_timer()
    res = matrix @ input_nbrs
    end = default_timer()
    print(end-start)

perf_measure(sobol_c_reshape)
perf_measure(sobol_f_reshape)

New contributor

Severin is a new contributor to this site. Take care in asking for clarification, commenting, and answering.
Check out our Code of Conduct.

Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức sự kiện 5 sao Thông tin về chúng tôi Dịch vụ sinh nhật bé trai Dịch vụ sinh nhật bé gái Sự kiện trọn gói Các tiết mục giải trí Dịch vụ bổ trợ Tiệc cưới sang trọng Dịch vụ khai trương Tư vấn tổ chức sự kiện Hình ảnh sự kiện Cập nhật tin tức Liên hệ ngay Thuê chú hề chuyên nghiệp Tiệc tất niên cho công ty Trang trí tiệc cuối năm Tiệc tất niên độc đáo Sinh nhật bé Hải Đăng Sinh nhật đáng yêu bé Khánh Vân Sinh nhật sang trọng Bích Ngân Tiệc sinh nhật bé Thanh Trang Dịch vụ ông già Noel Xiếc thú vui nhộn Biểu diễn xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức tiệc uy tín Khám phá dịch vụ của chúng tôi Tiệc sinh nhật cho bé trai Trang trí tiệc cho bé gái Gói sự kiện chuyên nghiệp Chương trình giải trí hấp dẫn Dịch vụ hỗ trợ sự kiện Trang trí tiệc cưới đẹp Khởi đầu thành công với khai trương Chuyên gia tư vấn sự kiện Xem ảnh các sự kiện đẹp Tin mới về sự kiện Kết nối với đội ngũ chuyên gia Chú hề vui nhộn cho tiệc sinh nhật Ý tưởng tiệc cuối năm Tất niên độc đáo Trang trí tiệc hiện đại Tổ chức sinh nhật cho Hải Đăng Sinh nhật độc quyền Khánh Vân Phong cách tiệc Bích Ngân Trang trí tiệc bé Thanh Trang Thuê dịch vụ ông già Noel chuyên nghiệp Xem xiếc khỉ đặc sắc Xiếc quay đĩa thú vị
Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa
Thiết kế website Thiết kế website Thiết kế website Cách kháng tài khoản quảng cáo Mua bán Fanpage Facebook Dịch vụ SEO Tổ chức sinh nhật