METIS fails to partition a 297 nodes graph into 64 parts : bisect a graph with 0 vertices

So like said in the title, I’m trying to partition a graph using METIS. More precisely, I have a mesh that has 297 elements, so those are the 297 nodes of the graph and I want to partition it into 64 parts for distributing the workload on different MPI processes. So the nodes/elements are weighted by their computational cost, and for simplicity one can say it is the number of nodes within each element.

Here is an adaptation of my block of code from inside my function :

size_t nME = 297;
std::vector<idx_t> xadj = {0, 3, 6, 10, 14, 18, 22, 26, 30, 34, 38, 42, 46, 49, 52, 56, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 94, 98, 102, 106, 111, 116, 121, 126, 131, 136, 140, 144, 148, 152, 157, 162, 167, 172, 177, 182, 187, 192, 197, 202, 206, 210, 214, 218, 223, 228, 233, 238, 243, 248, 252, 256, 260, 264, 269, 274, 279, 284, 289, 294, 298, 302, 306, 310, 315, 320, 325, 330, 335, 340, 345, 350, 355, 360, 364, 368, 372, 377, 382, 388, 393, 399, 404, 410, 415, 421, 426, 432, 436, 441, 445, 449, 454, 459, 464, 469, 474, 479, 484, 489, 494, 499, 503, 507, 511, 516, 521, 527, 532, 538, 543, 549, 554, 560, 565, 571, 575, 580, 583, 586, 590, 594, 598, 602, 606, 610, 614, 618, 622, 626, 629, 632, 635, 639, 643, 647, 651, 655, 658, 661, 665, 669, 673, 677, 681, 684, 687, 691, 695, 699, 703, 707, 710, 713, 717, 721, 725, 729, 733, 736, 739, 743, 747, 751, 755, 759, 762, 765, 769, 773, 777, 781, 785, 788, 791, 795, 799, 803, 807, 811, 814, 817, 821, 825, 829, 833, 837, 840, 843, 847, 851, 855, 859, 863, 866, 871, 876, 881, 886, 891, 896, 901, 906, 911, 916, 921, 926, 931, 936, 941, 946, 951, 956, 961, 966, 971, 976, 981, 986, 991, 996, 1001, 1006, 1011, 1016, 1021, 1026, 1031, 1036, 1041, 1046, 1051, 1056, 1061, 1066, 1071, 1076, 1081, 1086, 1091, 1096, 1101, 1106, 1111, 1116, 1121, 1126, 1131, 1136, 1141, 1146, 1150, 1154, 1158, 1162, 1166, 1170, 1174, 1178, 1182, 1186, 1190, 1194, 1199, 1204, 1209, 1214, 1219, 1224, 1229, 1234, 1238, 1242, 1246, 1250, 1254, 1258, 1262, 1266, 1270, 1274, 1278, 1282, 1287, 1292, 1297, 1302, 1307, 1312, 1317, 1322};
std::vector<idx_t> adjncy = {1, 2, 14, 0, 3, 15, 0, 3, 4, 289, 1, 2, 5, 290, 2, 5, 6, 273, 3, 4, 7, 274, 4, 7, 8, 16, 5, 6, 9, 17, 6, 9, 10, 18, 7, 8, 11, 19, 8, 11, 12, 20, 9, 10, 13, 21, 10, 13, 22, 11, 12, 23, 0, 15, 291, 24, 1, 14, 292, 25, 6, 17, 275, 18, 26, 7, 16, 276, 19, 27, 8, 16, 19, 20, 28, 9, 17, 18, 21, 29, 10, 18, 21, 22, 30, 11, 19, 20, 23, 31, 12, 20, 23, 32, 13, 21, 22, 33, 14, 25, 295, 34, 15, 24, 296, 35, 16, 27, 271, 28, 40, 17, 26, 272, 29, 41, 18, 26, 29, 30, 42, 19, 27, 28, 31, 43, 20, 28, 31, 32, 44, 21, 29, 30, 33, 45, 22, 30, 33, 46, 23, 31, 32, 47, 24, 35, 36, 48, 25, 34, 37, 49, 34, 37, 38, 293, 50, 35, 36, 39, 294, 51, 36, 39, 40, 269, 52, 37, 38, 41, 270, 53, 26, 38, 41, 42, 54, 27, 39, 40, 43, 55, 28, 40, 43, 44, 249, 29, 41, 42, 45, 250, 30, 42, 45, 46, 225, 31, 43, 44, 47, 226, 32, 44, 47, 56, 33, 45, 46, 57, 34, 49, 50, 58, 35, 48, 51, 59, 36, 48, 51, 52, 60, 37, 49, 50, 53, 61, 38, 50, 53, 54, 62, 39, 51, 52, 55, 63, 40, 52, 55, 251, 64, 41, 53, 54, 252, 65, 46, 57, 227, 66, 47, 56, 228, 67, 48, 59, 60, 68, 49, 58, 61, 69, 50, 58, 61, 62, 70, 51, 59, 60, 63, 71, 52, 60, 63, 64, 72, 53, 61, 62, 65, 73, 54, 62, 65, 255, 74, 55, 63, 64, 256, 75, 56, 67, 223, 80, 57, 66, 224, 81, 58, 69, 70, 82, 59, 68, 71, 83, 60, 68, 71, 72, 84, 61, 69, 70, 73, 85, 62, 70, 73, 74, 86, 63, 71, 72, 75, 87, 64, 72, 75, 76, 88, 65, 73, 74, 77, 89, 74, 77, 78, 253, 90, 75, 76, 79, 254, 91, 76, 79, 80, 221, 92, 77, 78, 81, 222, 93, 66, 78, 81, 94, 67, 79, 80, 95, 68, 83, 84, 96, 69, 82, 138, 85, 97, 70, 82, 85, 86, 98, 71, 83, 84, 139, 87, 99, 72, 84, 87, 88, 100, 73, 85, 86, 140, 89, 101, 74, 86, 89, 90, 102, 75, 87, 88, 141, 91, 103, 76, 88, 91, 92, 104, 77, 89, 90, 142, 93, 105, 78, 90, 93, 94, 106, 79, 91, 92, 143, 95, 107, 80, 92, 95, 108, 81, 93, 94, 144, 109, 82, 97, 98, 110, 83, 96, 99, 111, 84, 96, 99, 100, 112, 85, 97, 98, 101, 113, 86, 98, 101, 102, 114, 87, 99, 100, 103, 115, 88, 100, 103, 104, 116, 89, 101, 102, 105, 117, 90, 102, 105, 106, 118, 91, 103, 104, 107, 119, 92, 104, 107, 108, 120, 93, 105, 106, 109, 121, 94, 106, 109, 122, 95, 107, 108, 123, 96, 111, 112, 124, 97, 110, 194, 113, 125, 98, 110, 113, 114, 126, 99, 111, 112, 195, 115, 127, 100, 112, 115, 116, 128, 101, 113, 114, 196, 117, 129, 102, 114, 117, 118, 130, 103, 115, 116, 197, 119, 131, 104, 116, 119, 120, 132, 105, 117, 118, 198, 121, 133, 106, 118, 121, 122, 134, 107, 119, 120, 199, 123, 135, 108, 120, 123, 136, 109, 121, 122, 200, 137, 110, 125, 126, 111, 124, 127, 112, 124, 127, 128, 113, 125, 126, 129, 114, 126, 129, 130, 115, 127, 128, 131, 116, 128, 131, 132, 117, 129, 130, 133, 118, 130, 133, 134, 119, 131, 132, 135, 120, 132, 135, 136, 121, 133, 134, 137, 122, 134, 137, 123, 135, 136, 83, 139, 145, 85, 138, 140, 146, 87, 139, 141, 147, 89, 140, 142, 148, 91, 141, 143, 149, 93, 142, 144, 150, 95, 143, 151, 138, 146, 152, 139, 145, 147, 153, 140, 146, 148, 154, 141, 147, 149, 155, 142, 148, 150, 156, 143, 149, 151, 157, 144, 150, 158, 145, 153, 159, 146, 152, 154, 160, 147, 153, 155, 161, 148, 154, 156, 162, 149, 155, 157, 163, 150, 156, 158, 164, 151, 157, 165, 152, 160, 166, 153, 159, 161, 167, 154, 160, 162, 168, 155, 161, 163, 169, 156, 162, 164, 170, 157, 163, 165, 171, 158, 164, 172, 159, 167, 173, 160, 166, 168, 174, 161, 167, 169, 175, 162, 168, 170, 176, 163, 169, 171, 177, 164, 170, 172, 178, 165, 171, 179, 166, 174, 180, 167, 173, 175, 181, 168, 174, 176, 182, 169, 175, 177, 183, 170, 176, 178, 184, 171, 177, 179, 185, 172, 178, 186, 173, 181, 187, 174, 180, 182, 188, 175, 181, 183, 189, 176, 182, 184, 190, 177, 183, 185, 191, 178, 184, 186, 192, 179, 185, 193, 180, 188, 194, 181, 187, 189, 195, 182, 188, 190, 196, 183, 189, 191, 197, 184, 190, 192, 198, 185, 191, 193, 199, 186, 192, 200, 111, 187, 195, 113, 188, 194, 196, 115, 189, 195, 197, 117, 190, 196, 198, 119, 191, 197, 199, 121, 192, 198, 200, 123, 193, 199, 202, 203, 211, 231, 207, 201, 204, 212, 232, 208, 201, 204, 229, 205, 237, 202, 203, 230, 206, 238, 203, 206, 237, 207, 213, 204, 205, 238, 208, 214, 201, 205, 208, 211, 215, 202, 206, 207, 212, 216, 210, 211, 233, 231, 219, 209, 212, 234, 232, 220, 201, 207, 209, 212, 217, 202, 208, 210, 211, 218, 205, 214, 247, 215, 221, 206, 213, 248, 216, 222, 207, 213, 216, 217, 223, 208, 214, 215, 218, 224, 211, 215, 218, 219, 227, 212, 216, 217, 220, 228, 209, 217, 220, 241, 225, 210, 218, 219, 242, 226, 78, 213, 222, 253, 223, 79, 214, 221, 254, 224, 66, 215, 221, 224, 227, 67, 216, 222, 223, 228, 44, 219, 226, 227, 249, 45, 220, 225, 228, 250, 56, 217, 223, 225, 228, 57, 218, 224, 226, 227, 203, 230, 231, 239, 235, 204, 229, 232, 240, 236, 201, 209, 229, 232, 233, 202, 210, 230, 231, 234, 209, 231, 234, 235, 241, 210, 232, 233, 236, 242, 229, 233, 236, 239, 243, 230, 234, 235, 240, 244, 203, 205, 238, 239, 247, 204, 206, 237, 240, 248, 229, 235, 237, 240, 245, 230, 236, 238, 239, 246, 219, 233, 242, 243, 249, 220, 234, 241, 244, 250, 235, 241, 244, 245, 251, 236, 242, 243, 246, 252, 239, 243, 246, 247, 255, 240, 244, 245, 248, 256, 213, 237, 245, 248, 253, 214, 238, 246, 247, 254, 42, 225, 241, 250, 251, 43, 226, 242, 249, 252, 54, 243, 249, 252, 255, 55, 244, 250, 251, 256, 76, 221, 247, 254, 255, 77, 222, 248, 253, 256, 64, 245, 251, 253, 256, 65, 246, 252, 254, 255, 259, 267, 279, 263, 260, 268, 280, 264, 257, 277, 261, 285, 258, 278, 262, 286, 259, 285, 263, 269, 260, 286, 264, 270, 257, 261, 267, 271, 258, 262, 268, 272, 267, 281, 279, 273, 268, 282, 280, 274, 257, 263, 265, 275, 258, 264, 266, 276, 38, 261, 270, 293, 271, 39, 262, 269, 294, 272, 26, 263, 269, 272, 275, 27, 264, 270, 271, 276, 4, 265, 274, 275, 289, 5, 266, 273, 276, 290, 16, 267, 271, 273, 276, 17, 268, 272, 274, 275, 259, 279, 287, 283, 260, 280, 288, 284, 257, 265, 277, 281, 258, 266, 278, 282, 265, 279, 283, 289, 266, 280, 284, 290, 277, 281, 287, 291, 278, 282, 288, 292, 259, 261, 287, 293, 260, 262, 288, 294, 277, 283, 285, 295, 278, 284, 286, 296, 2, 273, 281, 290, 291, 3, 274, 282, 289, 292, 14, 283, 289, 292, 295, 15, 284, 290, 291, 296, 36, 269, 285, 294, 295, 37, 270, 286, 293, 296, 24, 287, 291, 293, 296, 25, 288, 292, 294, 295};
std::vector<idx_t> weight = {254100, 326700, 23100, 29700, 23100, 29700, 231000, 297000, 13860, 17820, 13860, 17820, 565950, 727650, 23100, 29700, 21000, 27000, 1260, 1620, 1260, 1620, 51450, 66150, 23100, 29700, 21000, 27000, 1260, 1620, 1260, 1620, 51450, 66150, 254100, 326700, 23100, 29700, 23100, 29700, 231000, 297000, 13860, 17820, 13860, 17820, 565950, 727650, 13860, 17820, 1260, 1620, 1260, 1620, 12600, 16200, 30870, 39690, 13860, 17820, 1260, 1620, 1260, 1620, 12600, 16200, 30870, 39690, 127050, 163350, 11550, 14850, 11550, 14850, 115500, 148500, 6930, 8910, 6930, 8910, 282975, 363825, 57750, 74250, 5250, 6750, 5250, 6750, 52500, 67500, 3150, 4050, 3150, 4050, 128625, 165375, 196350, 252450, 17850, 22950, 17850, 22950, 178500, 229500, 10710, 13770, 10710, 13770, 437325, 562275, 57750, 74250, 5250, 6750, 5250, 6750, 52500, 67500, 3150, 4050, 3150, 4050, 128625, 165375, 92400, 118800, 8400, 10800, 8400, 10800, 84000, 108000, 5040, 6480, 5040, 6480, 205800, 264600, 99000, 9000, 9000, 90000, 5400, 5400, 220500, 23760, 2160, 2160, 21600, 1296, 1296, 52920, 118800, 10800, 10800, 108000, 6480, 6480, 264600, 23760, 2160, 2160, 21600, 1296, 1296, 52920, 118800, 10800, 10800, 108000, 6480, 6480, 264600, 23760, 2160, 2160, 21600, 1296, 1296, 52920, 118800, 10800, 10800, 108000, 6480, 6480, 264600, 23760, 2160, 2160, 21600, 1296, 1296, 52920, 99000, 9000, 9000, 90000, 5400, 5400, 220500, 756, 972, 756, 972, 630, 810, 630, 810, 630, 810, 630, 810, 378, 486, 378, 486, 378, 486, 378, 486, 630, 810, 630, 810, 630, 810, 630, 810, 756, 972, 756, 972, 630, 810, 630, 810, 630, 810, 630, 810, 378, 486, 378, 486, 378, 486, 378, 486, 630, 810, 630, 810, 630, 810, 630, 810, 2100, 2700, 2100, 2700, 1260, 1620, 1260, 1620, 1260, 1620, 1260, 1620, 1260, 1620, 1260, 1620, 1260, 1620, 1260, 1620, 2100, 2700, 2100, 2700, 1260, 1620, 1260, 1620, 1260, 1620, 1260, 1620, 1260, 1620, 1260, 1620, 1260, 1620, 1260, 1620};

if (xadj.size() != nME + 1 || adjncy.size() != xadj.back())
   throw std::runtime_error("xadj or adjncy tables are wrong.");
            
idx_t n = nME;
idx_t ncon = 1;
idx_t nparts = 64;
idx_t part[n], objval;
idx_t options[METIS_NOPTIONS];
METIS_SetDefaultOptions(options);
options[METIS_OPTION_OBJTYPE] = METIS_OBJTYPE_VOL;
options[METIS_OPTION_CTYPE] = METIS_CTYPE_SHEM;
options[METIS_OPTION_IPTYPE] = METIS_IPTYPE_GROW;
options[METIS_OPTION_RTYPE] = METIS_RTYPE_FM;
options[METIS_OPTION_NO2HOP] = 1;
options[METIS_OPTION_NCUTS] = 10;
options[METIS_OPTION_MINCONN] = 1;
options[METIS_OPTION_CONTIG] = 1;
options[METIS_OPTION_NUMBERING] = 0;

options[METIS_OPTION_UFACTOR] = 10; // Used to set a limit on imbalanceness between partitions
options[METIS_OPTION_SEED] = 1; // Set a seed for the randomness
options[METIS_OPTION_NITER] = 10; // Set a max number of iterations for metis to do its work
// options[METIS_OPTION_DBGLVL] = METIS_DBG_INFO; // Set the verbose level for debugging

int status = METIS_PartGraphKway(&n, &ncon, xadj.data(), adjncy.data(), weight.data(), NULL, NULL, &nparts, NULL, NULL, options, &objval, part);

if (status != METIS_OK) {
   switch (status)
      {
         case METIS_ERROR_INPUT:
            throw std::runtime_error("Error: METIS's input error.");
            break;
         case METIS_ERROR_MEMORY:
            throw std::runtime_error("Error: METIS memory error.");
            break;                
                
          default:
             throw std::runtime_error("Error: METIS error.");
             break;
       }
   }

I’ve tried to set the options table with different things but none worked for 64 parts and beyond, but it worked for lower power of 2 : 2, 4, 8, 16 and 32.

The error return is an internal error of METIS saying this :

        ***Cannot bisect a graph with 0 vertices!
        ***You are trying to partition a graph into too many parts!

I would expect not only METIS to succed to partition the graph, but even more, since I’m using METIS_PartGraphKway routine, there should be no bisection of the initial graph that could lead to subgraph with 0 vertices, so very odd to me…

Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức sự kiện 5 sao Thông tin về chúng tôi Dịch vụ sinh nhật bé trai Dịch vụ sinh nhật bé gái Sự kiện trọn gói Các tiết mục giải trí Dịch vụ bổ trợ Tiệc cưới sang trọng Dịch vụ khai trương Tư vấn tổ chức sự kiện Hình ảnh sự kiện Cập nhật tin tức Liên hệ ngay Thuê chú hề chuyên nghiệp Tiệc tất niên cho công ty Trang trí tiệc cuối năm Tiệc tất niên độc đáo Sinh nhật bé Hải Đăng Sinh nhật đáng yêu bé Khánh Vân Sinh nhật sang trọng Bích Ngân Tiệc sinh nhật bé Thanh Trang Dịch vụ ông già Noel Xiếc thú vui nhộn Biểu diễn xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức tiệc uy tín Khám phá dịch vụ của chúng tôi Tiệc sinh nhật cho bé trai Trang trí tiệc cho bé gái Gói sự kiện chuyên nghiệp Chương trình giải trí hấp dẫn Dịch vụ hỗ trợ sự kiện Trang trí tiệc cưới đẹp Khởi đầu thành công với khai trương Chuyên gia tư vấn sự kiện Xem ảnh các sự kiện đẹp Tin mới về sự kiện Kết nối với đội ngũ chuyên gia Chú hề vui nhộn cho tiệc sinh nhật Ý tưởng tiệc cuối năm Tất niên độc đáo Trang trí tiệc hiện đại Tổ chức sinh nhật cho Hải Đăng Sinh nhật độc quyền Khánh Vân Phong cách tiệc Bích Ngân Trang trí tiệc bé Thanh Trang Thuê dịch vụ ông già Noel chuyên nghiệp Xem xiếc khỉ đặc sắc Xiếc quay đĩa thú vị
Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa
Thiết kế website Thiết kế website Thiết kế website Cách kháng tài khoản quảng cáo Mua bán Fanpage Facebook Dịch vụ SEO Tổ chức sinh nhật