LIME with binary DNN classifier, no “predict_proba”,

I want to use LIME for explaining my models results.

I have a DNN model ending with 1 neuron output layer with sigmoid function.

Nearly ALL examples I came across the internet had examples either on regression, or DT models.
I couldn’t find any matching my case.

Plain text
Copy to clipboard
Open code in new window
EnlighterJS 3 Syntax Highlighter
<code>DNN = tf.keras.models.Sequential([
#Input layer with 121 (nb of features) neurons
tf.keras.layers.Input(121),
#1st hidden layer with 182 neurons
tf.keras.layers.Dense(182, activation='relu'),
#Dropout layer with rate = 0.2
tf.keras.layers.Dropout(0.2),
#2nd hidden layer with 182 neurons
tf.keras.layers.Dense(182, activation='relu'),
#Ouput layer with 1 neuron
tf.keras.layers.Dense(1,activation='sigmoid')
])
DNN.compile(optimizer='adam',
loss="binary_crossentropy",
metrics=['accuracy'])
DNN_trained=DNN.fit(nsl_kdd_train_X2, nsl_kdd_train_Y2, epochs=5)
#lime
from lime import lime_tabular
explainer = lime_tabular.LimeTabularExplainer( training_data = np.array(nsl_kdd_train_X2),
feature_names = nsl_kdd_data_X2.columns,
class_names = ['normal', 'anomaly'],
mode="classification"
)
explainer = lime_tabular.LimeTabularExplainer(nsl_kdd_test_X2, mode='classification',feature_names=nsl_kdd_data_X2.columns, verbose=True) #,training_labels=nsl_kdd_data['class']
explanation = explainer.explain_instance(nsl_kdd_test_X2[1], DNN.predict_proba, num_features=len(nsl_kdd_data_X2.columns))
</code>
<code>DNN = tf.keras.models.Sequential([ #Input layer with 121 (nb of features) neurons tf.keras.layers.Input(121), #1st hidden layer with 182 neurons tf.keras.layers.Dense(182, activation='relu'), #Dropout layer with rate = 0.2 tf.keras.layers.Dropout(0.2), #2nd hidden layer with 182 neurons tf.keras.layers.Dense(182, activation='relu'), #Ouput layer with 1 neuron tf.keras.layers.Dense(1,activation='sigmoid') ]) DNN.compile(optimizer='adam', loss="binary_crossentropy", metrics=['accuracy']) DNN_trained=DNN.fit(nsl_kdd_train_X2, nsl_kdd_train_Y2, epochs=5) #lime from lime import lime_tabular explainer = lime_tabular.LimeTabularExplainer( training_data = np.array(nsl_kdd_train_X2), feature_names = nsl_kdd_data_X2.columns, class_names = ['normal', 'anomaly'], mode="classification" ) explainer = lime_tabular.LimeTabularExplainer(nsl_kdd_test_X2, mode='classification',feature_names=nsl_kdd_data_X2.columns, verbose=True) #,training_labels=nsl_kdd_data['class'] explanation = explainer.explain_instance(nsl_kdd_test_X2[1], DNN.predict_proba, num_features=len(nsl_kdd_data_X2.columns)) </code>
DNN = tf.keras.models.Sequential([
  #Input layer with 121 (nb of features) neurons
  tf.keras.layers.Input(121),

  #1st hidden layer with 182 neurons
  tf.keras.layers.Dense(182, activation='relu'),

  #Dropout layer with rate = 0.2
  tf.keras.layers.Dropout(0.2),

  #2nd hidden layer with 182 neurons
  tf.keras.layers.Dense(182, activation='relu'),

  #Ouput layer with 1 neuron
  tf.keras.layers.Dense(1,activation='sigmoid')
])

DNN.compile(optimizer='adam',
              loss="binary_crossentropy",
              metrics=['accuracy'])

DNN_trained=DNN.fit(nsl_kdd_train_X2, nsl_kdd_train_Y2, epochs=5)


#lime
from lime import lime_tabular
explainer = lime_tabular.LimeTabularExplainer( training_data = np.array(nsl_kdd_train_X2),
                                              feature_names = nsl_kdd_data_X2.columns,
                                              class_names = ['normal', 'anomaly'],
                                              mode="classification"
                                                )


explainer = lime_tabular.LimeTabularExplainer(nsl_kdd_test_X2, mode='classification',feature_names=nsl_kdd_data_X2.columns, verbose=True) #,training_labels=nsl_kdd_data['class']



explanation = explainer.explain_instance(nsl_kdd_test_X2[1], DNN.predict_proba, num_features=len(nsl_kdd_data_X2.columns))

it will give error: “AttributeError: ‘Sequential’ object has no attribute ‘predict_proba'”

so predict_proba is not available, and only predict function is, which outputs 0 or 1 only.

I tried to borrow this part of code:

Plain text
Copy to clipboard
Open code in new window
EnlighterJS 3 Syntax Highlighter
<code>def prob(data):
return np.array(list(zip(1-model.predict(data),model.predict(data))))
</code>
<code>def prob(data): return np.array(list(zip(1-model.predict(data),model.predict(data)))) </code>
def prob(data):
    return np.array(list(zip(1-model.predict(data),model.predict(data))))

from

https://towardsdatascience.com/decrypting-your-machine-learning-model-using-lime-5adc035109b5

but it transformed the data into 3D array, which LIME explain_instance function complained from. I’m not sure why it became 3D.

Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức sự kiện 5 sao Thông tin về chúng tôi Dịch vụ sinh nhật bé trai Dịch vụ sinh nhật bé gái Sự kiện trọn gói Các tiết mục giải trí Dịch vụ bổ trợ Tiệc cưới sang trọng Dịch vụ khai trương Tư vấn tổ chức sự kiện Hình ảnh sự kiện Cập nhật tin tức Liên hệ ngay Thuê chú hề chuyên nghiệp Tiệc tất niên cho công ty Trang trí tiệc cuối năm Tiệc tất niên độc đáo Sinh nhật bé Hải Đăng Sinh nhật đáng yêu bé Khánh Vân Sinh nhật sang trọng Bích Ngân Tiệc sinh nhật bé Thanh Trang Dịch vụ ông già Noel Xiếc thú vui nhộn Biểu diễn xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức tiệc uy tín Khám phá dịch vụ của chúng tôi Tiệc sinh nhật cho bé trai Trang trí tiệc cho bé gái Gói sự kiện chuyên nghiệp Chương trình giải trí hấp dẫn Dịch vụ hỗ trợ sự kiện Trang trí tiệc cưới đẹp Khởi đầu thành công với khai trương Chuyên gia tư vấn sự kiện Xem ảnh các sự kiện đẹp Tin mới về sự kiện Kết nối với đội ngũ chuyên gia Chú hề vui nhộn cho tiệc sinh nhật Ý tưởng tiệc cuối năm Tất niên độc đáo Trang trí tiệc hiện đại Tổ chức sinh nhật cho Hải Đăng Sinh nhật độc quyền Khánh Vân Phong cách tiệc Bích Ngân Trang trí tiệc bé Thanh Trang Thuê dịch vụ ông già Noel chuyên nghiệp Xem xiếc khỉ đặc sắc Xiếc quay đĩa thú vị
Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa
Thiết kế website Thiết kế website Thiết kế website Cách kháng tài khoản quảng cáo Mua bán Fanpage Facebook Dịch vụ SEO Tổ chức sinh nhật