Launching a service from SLURM task prolog script fails

On the HPC I work with, I have to use docker in rootless-mode by calling a script start-docker.sh on every job.
To automate this, I would like to use the --task-prolog argument of srun and have the script called from a task_prolog.sh script:

Plain text
Copy to clipboard
Open code in new window
EnlighterJS 3 Syntax Highlighter
<code>#!/usr/bin/env sh
nohup start-docker.sh > docker-server.log 2&>1 &
</code>
<code>#!/usr/bin/env sh nohup start-docker.sh > docker-server.log 2&>1 & </code>
#!/usr/bin/env sh
nohup start-docker.sh > docker-server.log 2&>1 &

With start-docker.sh responsible to launch dockerd-rootless.sh:

Plain text
Copy to clipboard
Open code in new window
EnlighterJS 3 Syntax Highlighter
<code>#!/usr/bin/env bash
source /tmp/slurm/username/env.txt
dockerd-rootless.sh --host=$DOCKER_HOST --data-root=/storage/docker-data/username/ --exec-root=${XDG_RUNTIME_DIR}/
</code>
<code>#!/usr/bin/env bash source /tmp/slurm/username/env.txt dockerd-rootless.sh --host=$DOCKER_HOST --data-root=/storage/docker-data/username/ --exec-root=${XDG_RUNTIME_DIR}/ </code>
#!/usr/bin/env bash
source /tmp/slurm/username/env.txt
dockerd-rootless.sh --host=$DOCKER_HOST --data-root=/storage/docker-data/username/ --exec-root=${XDG_RUNTIME_DIR}/

The SLURM documentation for prolog scripts shows examples of setting environment variables or printing messages but nothing for executing a script.

Using this approach, despite the start-docker.sh script being launched, no docker-server is running.
Inspection of docker-server.log shows that the dockerd-rootless.sh script is called too, but seems ultimately interrupted when calling rootlesskit as it is the last command logged:

Plain text
Copy to clipboard
Open code in new window
EnlighterJS 3 Syntax Highlighter
<code>+ exec rootlesskit --state-dir=/run/user/8076/dockerd-rootless --net=slirp4netns --mtu=65520 --slirp4netns-sandbox=auto --slirp4netns-seccomp=auto --disable-host-loopback --port-driver=builtin --copy-up=/etc --copy-up=/run --propagation=rslave /usr/bin/dockerd-rootless.sh --host=unix:///run/user/8076/docker.sock --data-root=/storage/docker-data/username/ --exec-root=/run/user/8076/
</code>
<code>+ exec rootlesskit --state-dir=/run/user/8076/dockerd-rootless --net=slirp4netns --mtu=65520 --slirp4netns-sandbox=auto --slirp4netns-seccomp=auto --disable-host-loopback --port-driver=builtin --copy-up=/etc --copy-up=/run --propagation=rslave /usr/bin/dockerd-rootless.sh --host=unix:///run/user/8076/docker.sock --data-root=/storage/docker-data/username/ --exec-root=/run/user/8076/ </code>
+ exec rootlesskit --state-dir=/run/user/8076/dockerd-rootless --net=slirp4netns --mtu=65520 --slirp4netns-sandbox=auto --slirp4netns-seccomp=auto --disable-host-loopback --port-driver=builtin --copy-up=/etc --copy-up=/run --propagation=rslave /usr/bin/dockerd-rootless.sh --host=unix:///run/user/8076/docker.sock --data-root=/storage/docker-data/username/ --exec-root=/run/user/8076/

Nonetheless, when start-docker.sh is called manually, additional lines are logged after the one from rootlesskit and the docker server runs as expected.

I don’t understand why the script seems interrupted. Is the process running the prolog script killed at some point?

Thanks for your help.

4

Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức sự kiện 5 sao Thông tin về chúng tôi Dịch vụ sinh nhật bé trai Dịch vụ sinh nhật bé gái Sự kiện trọn gói Các tiết mục giải trí Dịch vụ bổ trợ Tiệc cưới sang trọng Dịch vụ khai trương Tư vấn tổ chức sự kiện Hình ảnh sự kiện Cập nhật tin tức Liên hệ ngay Thuê chú hề chuyên nghiệp Tiệc tất niên cho công ty Trang trí tiệc cuối năm Tiệc tất niên độc đáo Sinh nhật bé Hải Đăng Sinh nhật đáng yêu bé Khánh Vân Sinh nhật sang trọng Bích Ngân Tiệc sinh nhật bé Thanh Trang Dịch vụ ông già Noel Xiếc thú vui nhộn Biểu diễn xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức tiệc uy tín Khám phá dịch vụ của chúng tôi Tiệc sinh nhật cho bé trai Trang trí tiệc cho bé gái Gói sự kiện chuyên nghiệp Chương trình giải trí hấp dẫn Dịch vụ hỗ trợ sự kiện Trang trí tiệc cưới đẹp Khởi đầu thành công với khai trương Chuyên gia tư vấn sự kiện Xem ảnh các sự kiện đẹp Tin mới về sự kiện Kết nối với đội ngũ chuyên gia Chú hề vui nhộn cho tiệc sinh nhật Ý tưởng tiệc cuối năm Tất niên độc đáo Trang trí tiệc hiện đại Tổ chức sinh nhật cho Hải Đăng Sinh nhật độc quyền Khánh Vân Phong cách tiệc Bích Ngân Trang trí tiệc bé Thanh Trang Thuê dịch vụ ông già Noel chuyên nghiệp Xem xiếc khỉ đặc sắc Xiếc quay đĩa thú vị
Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa
Thiết kế website Thiết kế website Thiết kế website Cách kháng tài khoản quảng cáo Mua bán Fanpage Facebook Dịch vụ SEO Tổ chức sinh nhật