Lasso Regression for variable selection with fixed feature set in Python

There are two posts related to this topic in R language including fixed regressor in a Lasso regression model and fixed effect Lasso logit model

I am writing a feature selection model using Lasso penalisation, my data has some seasonal dummy variables and they must not be dropped during the modelling phase. The easiest way to do so is the shrinkage applied to the coefficients on the linear model should avoid the coefficients of fixed features. Could you please help me write a custom Lasso function which does not shrink the coefficients of fixed features and is callable in sklearn Pipeline?**

Plain text
Copy to clipboard
Open code in new window
EnlighterJS 3 Syntax Highlighter
<code> from sklearn.pipeline import Pipeline
pipeline = Pipeline([
('scaler', StandardScaler()), # Optional: Feature scaling
('lasso', LassoWithFixedFeatures(fixed_features_indices))
])
</code>
<code> from sklearn.pipeline import Pipeline pipeline = Pipeline([ ('scaler', StandardScaler()), # Optional: Feature scaling ('lasso', LassoWithFixedFeatures(fixed_features_indices)) ]) </code>
    from sklearn.pipeline import Pipeline
    pipeline = Pipeline([
           ('scaler', StandardScaler()),  # Optional: Feature scaling
           ('lasso', LassoWithFixedFeatures(fixed_features_indices))
     ])

I have tried this,

Plain text
Copy to clipboard
Open code in new window
EnlighterJS 3 Syntax Highlighter
<code>from sklearn.base import BaseEstimator, RegressorMixin
from sklearn.linear_model import Lasso
import numpy as np
class LassoWithFixedFeatures(BaseEstimator, RegressorMixin):
def __init__(self, fixed_features_indices, alpha=1.0):
self.fixed_features_indices = fixed_features_indices
self.alpha = alpha
def fit(self, X, y):
# Fit Lasso model with regularized coefficients
self.lasso = Lasso(alpha=self.alpha)
self.lasso.fit(X, y)
# Calculate the penalty term for fixed features
penalty_fixed = self.alpha * np.abs(self.lasso.coef_[self.fixed_features_indices])
# Set coefficients of fixed features to their original values
fixed_features_coefs = np.linalg.lstsq(X[:, self.fixed_features_indices], y, rcond=None)[0]
self.coef_ = np.zeros(X.shape[1])
self.coef_[self.fixed_features_indices] = fixed_features_coefs
# Calculate the penalty term for non-fixed features
penalty_non_fixed = np.zeros(X.shape[1])
penalty_non_fixed[self.fixed_features_indices] = 0 # Exclude fixed features from penalty
penalty_non_fixed[~np.isin(np.arange(X.shape[1]), self.fixed_features_indices)] = self.alpha * np.abs(self.lasso.coef_)
# Update coefficients by considering penalties
self.coef_ += self.lasso.coef_ - penalty_non_fixed + penalty_fixed
return self
def predict(self, X):
return np.dot(X, self.coef_)
</code>
<code>from sklearn.base import BaseEstimator, RegressorMixin from sklearn.linear_model import Lasso import numpy as np class LassoWithFixedFeatures(BaseEstimator, RegressorMixin): def __init__(self, fixed_features_indices, alpha=1.0): self.fixed_features_indices = fixed_features_indices self.alpha = alpha def fit(self, X, y): # Fit Lasso model with regularized coefficients self.lasso = Lasso(alpha=self.alpha) self.lasso.fit(X, y) # Calculate the penalty term for fixed features penalty_fixed = self.alpha * np.abs(self.lasso.coef_[self.fixed_features_indices]) # Set coefficients of fixed features to their original values fixed_features_coefs = np.linalg.lstsq(X[:, self.fixed_features_indices], y, rcond=None)[0] self.coef_ = np.zeros(X.shape[1]) self.coef_[self.fixed_features_indices] = fixed_features_coefs # Calculate the penalty term for non-fixed features penalty_non_fixed = np.zeros(X.shape[1]) penalty_non_fixed[self.fixed_features_indices] = 0 # Exclude fixed features from penalty penalty_non_fixed[~np.isin(np.arange(X.shape[1]), self.fixed_features_indices)] = self.alpha * np.abs(self.lasso.coef_) # Update coefficients by considering penalties self.coef_ += self.lasso.coef_ - penalty_non_fixed + penalty_fixed return self def predict(self, X): return np.dot(X, self.coef_) </code>
from sklearn.base import BaseEstimator, RegressorMixin
from sklearn.linear_model import Lasso
import numpy as np

class LassoWithFixedFeatures(BaseEstimator, RegressorMixin):
    def __init__(self, fixed_features_indices, alpha=1.0):
        self.fixed_features_indices = fixed_features_indices
        self.alpha = alpha

    def fit(self, X, y):
        # Fit Lasso model with regularized coefficients
        self.lasso = Lasso(alpha=self.alpha)
        self.lasso.fit(X, y)

        # Calculate the penalty term for fixed features
        penalty_fixed = self.alpha * np.abs(self.lasso.coef_[self.fixed_features_indices])

        # Set coefficients of fixed features to their original values
        fixed_features_coefs = np.linalg.lstsq(X[:, self.fixed_features_indices], y, rcond=None)[0]
        self.coef_ = np.zeros(X.shape[1])
        self.coef_[self.fixed_features_indices] = fixed_features_coefs

        # Calculate the penalty term for non-fixed features
        penalty_non_fixed = np.zeros(X.shape[1])
        penalty_non_fixed[self.fixed_features_indices] = 0  # Exclude fixed features from penalty
        penalty_non_fixed[~np.isin(np.arange(X.shape[1]), self.fixed_features_indices)] = self.alpha * np.abs(self.lasso.coef_)

        # Update coefficients by considering penalties
        self.coef_ += self.lasso.coef_ - penalty_non_fixed + penalty_fixed

        return self

    def predict(self, X): 
        return np.dot(X, self.coef_)

I was expecting lasso regresson with custom shrinkage but got ValueError:
All the 500 fits failed.
It is very likely that your model is misconfigured.
You can try to debug the error by setting error_score=’raise’.

Below are more details about the failures:

500 fits failed with the following error:
Traceback (most recent call last):
File “C:Usersaaditanaconda3Libsite-packagessklearnmodel_selection_validation.py”, line 732, in _fit_and_score
estimator.fit(X_train, y_train, **fit_params)
File “C:Usersaaditanaconda3Libsite-packagessklearnbase.py”, line 1151, in wrapper
return fit_method(estimator, *args, **kwargs)
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
File “C:Usersaaditanaconda3Libsite-packagessklearnpipeline.py”, line 420, in fit
self.final_estimator.fit(Xt, y, **fit_params_last_step)
File “C:UsersaaditAppDataLocalTempipykernel_205082286835759.py”, line 26, in fit
penalty_non_fixed[~np.isin(np.arange(X.shape1), self.fixed_features_indices)] = self.alpha * np.abs(self.lasso.coef
)
~~~~~~~~~~~~~~~~~^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
ValueError: NumPy boolean array indexing assignment cannot assign 18 input values to the 11 output values where the mask is true

Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức sự kiện 5 sao Thông tin về chúng tôi Dịch vụ sinh nhật bé trai Dịch vụ sinh nhật bé gái Sự kiện trọn gói Các tiết mục giải trí Dịch vụ bổ trợ Tiệc cưới sang trọng Dịch vụ khai trương Tư vấn tổ chức sự kiện Hình ảnh sự kiện Cập nhật tin tức Liên hệ ngay Thuê chú hề chuyên nghiệp Tiệc tất niên cho công ty Trang trí tiệc cuối năm Tiệc tất niên độc đáo Sinh nhật bé Hải Đăng Sinh nhật đáng yêu bé Khánh Vân Sinh nhật sang trọng Bích Ngân Tiệc sinh nhật bé Thanh Trang Dịch vụ ông già Noel Xiếc thú vui nhộn Biểu diễn xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức tiệc uy tín Khám phá dịch vụ của chúng tôi Tiệc sinh nhật cho bé trai Trang trí tiệc cho bé gái Gói sự kiện chuyên nghiệp Chương trình giải trí hấp dẫn Dịch vụ hỗ trợ sự kiện Trang trí tiệc cưới đẹp Khởi đầu thành công với khai trương Chuyên gia tư vấn sự kiện Xem ảnh các sự kiện đẹp Tin mới về sự kiện Kết nối với đội ngũ chuyên gia Chú hề vui nhộn cho tiệc sinh nhật Ý tưởng tiệc cuối năm Tất niên độc đáo Trang trí tiệc hiện đại Tổ chức sinh nhật cho Hải Đăng Sinh nhật độc quyền Khánh Vân Phong cách tiệc Bích Ngân Trang trí tiệc bé Thanh Trang Thuê dịch vụ ông già Noel chuyên nghiệp Xem xiếc khỉ đặc sắc Xiếc quay đĩa thú vị
Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa
Thiết kế website Thiết kế website Thiết kế website Cách kháng tài khoản quảng cáo Mua bán Fanpage Facebook Dịch vụ SEO Tổ chức sinh nhật