Feature selection and Prediction in DGL Link Prediction

I am new to this field and I am trying to do link-prediction using DGL on the given graph. I am struggling to create features for the graph and at last to do inference. My pipeline is working, I have used the code provided on – DGL_Link_Prediction. I have tried to read many tutorials and blogs but no one has taught me how to do link prediction between two nodes (whether a link exists or not), say node 89 and node 30.
This is my code-

src = [...] #list of source node
dst = [...] #list of destination node
src_tensor = torch.tensor(src)
dst_tensor = torch.tensor(dst)
g = dgl.graph((src_tensor, dst_tensor))
g = g.int()
g = dgl.to_bidirected(g)

#creating features (need help here) (a better approach)
nx_g = g.to_networkx()

betweenness = nx.betweenness_centrality(nx_g)
closeness = nx.closeness_centrality(nx_g)

centrality_features = torch.tensor([[betweenness[n], closeness[n]] for n in nx_g.nodes()])
g.ndata['feat'] = centrality_features

# Split edge set for training and testing
u, v = g.edges()

eids = np.arange(g.number_of_edges())
eids = np.random.permutation(eids)
test_size = int(len(eids) * 0.1)
train_size = g.number_of_edges() - test_size
test_pos_u, test_pos_v = u[eids[:test_size]], v[eids[:test_size]]
train_pos_u, train_pos_v = u[eids[test_size:]], v[eids[test_size:]]

# Find all negative edges and split them for training and testing
adj = sp.coo_matrix((np.ones(len(u)), (u.numpy(), v.numpy())))
adj_neg = 1 - adj.todense() - np.eye(g.number_of_nodes())
neg_u, neg_v = np.where(adj_neg != 0)

neg_eids = np.random.choice(len(neg_u), g.number_of_edges())
test_neg_u, test_neg_v = neg_u[neg_eids[:test_size]], neg_v[neg_eids[:test_size]]
train_neg_u, train_neg_v = neg_u[neg_eids[test_size:]], neg_v[neg_eids[test_size:]]

train_g = dgl.remove_edges(g, eids[:test_size])

from dgl.nn import SAGEConv

# ----------- 2. create model -------------- #
# build a two-layer GraphSAGE model
class GraphSAGE(nn.Module):
    def __init__(self, in_feats, h_feats):
        super(GraphSAGE, self).__init__()
        self.conv1 = SAGEConv(in_feats, h_feats, 'mean')
        self.conv2 = SAGEConv(h_feats, h_feats, 'mean')

    def forward(self, g, in_feat):
        h = self.conv1(g, in_feat)
        h = F.relu(h)
        h = self.conv2(g, h)
        return h

train_pos_g = dgl.graph((train_pos_u, train_pos_v), num_nodes=g.number_of_nodes())
train_neg_g = dgl.graph((train_neg_u, train_neg_v), num_nodes=g.number_of_nodes())

test_pos_g = dgl.graph((test_pos_u, test_pos_v), num_nodes=g.number_of_nodes())
test_neg_g = dgl.graph((test_neg_u, test_neg_v), num_nodes=g.number_of_nodes())

import dgl.function as fn

class DotPredictor(nn.Module):
    def forward(self, g, h):
        with g.local_scope():
            g.ndata['h'] = h
            # Compute a new edge feature named 'score' by a dot-product between the
            # source node feature 'h' and destination node feature 'h'.
            g.apply_edges(fn.u_dot_v('h', 'h', 'score'))
            # u_dot_v returns a 1-element vector for each edge so you need to squeeze it.
            return g.edata['score'][:, 0]

model = GraphSAGE(train_g.ndata['feat'].shape[1], 16)
# You can replace DotPredictor with MLPPredictor.
#pred = MLPPredictor(16)
pred = DotPredictor()

def compute_loss(pos_score, neg_score):
    scores = torch.cat([pos_score, neg_score])
    labels = torch.cat([torch.ones(pos_score.shape[0]), torch.zeros(neg_score.shape[0])])
    return F.binary_cross_entropy_with_logits(scores, labels)

def compute_auc(pos_score, neg_score):
    scores = torch.cat([pos_score, neg_score]).numpy()
    labels = torch.cat(
        [torch.ones(pos_score.shape[0]), torch.zeros(neg_score.shape[0])]).numpy()
    return roc_auc_score(labels, scores)

# ----------- 3. set up loss and optimizer -------------- #
# in this case, loss will in training loop
optimizer = torch.optim.Adam(itertools.chain(model.parameters(), pred.parameters()), lr=0.01)

# ----------- 4. training -------------------------------- #
all_logits = []
for e in range(100):
    # forward
    h = model(train_g, train_g.ndata['feat'])
    pos_score = pred(train_pos_g, h)
    neg_score = pred(train_neg_g, h)
    loss = compute_loss(pos_score, neg_score)

    # backward
    optimizer.zero_grad()
    loss.backward()
    optimizer.step()

    if e % 5 == 0:
        print('In epoch {}, loss: {}'.format(e, loss))

# ----------- 5. check results ------------------------ #
from sklearn.metrics import roc_auc_score
with torch.no_grad():
    pos_score = pred(test_pos_g, h)
    neg_score = pred(test_neg_g, h)
    print('AUC', compute_auc(pos_score, neg_score))
pred_src=[45,68,843,234,2,457,2]
pred_src=[67,89,5,45,346,12,698]

#Now how to do prediction for a link between node 45 and 67 or any other. I have a list of edges for which I have to do the link prediction.

Thanks

Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức sự kiện 5 sao Thông tin về chúng tôi Dịch vụ sinh nhật bé trai Dịch vụ sinh nhật bé gái Sự kiện trọn gói Các tiết mục giải trí Dịch vụ bổ trợ Tiệc cưới sang trọng Dịch vụ khai trương Tư vấn tổ chức sự kiện Hình ảnh sự kiện Cập nhật tin tức Liên hệ ngay Thuê chú hề chuyên nghiệp Tiệc tất niên cho công ty Trang trí tiệc cuối năm Tiệc tất niên độc đáo Sinh nhật bé Hải Đăng Sinh nhật đáng yêu bé Khánh Vân Sinh nhật sang trọng Bích Ngân Tiệc sinh nhật bé Thanh Trang Dịch vụ ông già Noel Xiếc thú vui nhộn Biểu diễn xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức tiệc uy tín Khám phá dịch vụ của chúng tôi Tiệc sinh nhật cho bé trai Trang trí tiệc cho bé gái Gói sự kiện chuyên nghiệp Chương trình giải trí hấp dẫn Dịch vụ hỗ trợ sự kiện Trang trí tiệc cưới đẹp Khởi đầu thành công với khai trương Chuyên gia tư vấn sự kiện Xem ảnh các sự kiện đẹp Tin mới về sự kiện Kết nối với đội ngũ chuyên gia Chú hề vui nhộn cho tiệc sinh nhật Ý tưởng tiệc cuối năm Tất niên độc đáo Trang trí tiệc hiện đại Tổ chức sinh nhật cho Hải Đăng Sinh nhật độc quyền Khánh Vân Phong cách tiệc Bích Ngân Trang trí tiệc bé Thanh Trang Thuê dịch vụ ông già Noel chuyên nghiệp Xem xiếc khỉ đặc sắc Xiếc quay đĩa thú vị
Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa
Thiết kế website Thiết kế website Thiết kế website Cách kháng tài khoản quảng cáo Mua bán Fanpage Facebook Dịch vụ SEO Tổ chức sinh nhật