Cluster analysis – rejoin clusters to dataframe correctly

I have a df that is long where each participant is a row.

set.seed(123)  # for reproducibility

participants <- c("Participant1", "Participant2", "Participant3")
symptoms <- paste0("Symptom", 1:5)

# Create wide format dataframe
main_cl_db <- data.frame(
  participant_id = participants,
  sapply(symptoms, function(sym) sample(c(0, 1), 3, replace = TRUE))  # Generate binary data for symptoms
)

# Display the main_cl_db
print("Original Data (wide format):")
print(main_cl_db)

I then create
main_cl_db_no_id <- main_cl_db %>% select(-participant_id) – removing id so it’s only binary data of symptoms

main_cl_db_t <- t(main_cl_db_no_id) – transposed for clustering where I am clustering the symptoms

I now want to go back to my original df called new_main_cl_db where it’s the same format but it has the cluster number derived from the analysis. Essentially, I want the same frame as main_cl_db but it now has a new column called cluster

All the code for my analysis is below

# data prep ---------------------------------------------------------------
# Select relevant columns and prepare data
main_cl_db <- main_survey %>%
  select(participant_id, starts_with("symptoms_new")) %>%
  mutate(across(starts_with("symptoms_new"), ~ ifelse(is.na(.), 0, .))) %>% 
  mutate_if(is.double, as.factor) #ensures they are treated as factors/binary 


# Remove participant_id column for clustering
main_cl_db_no_id <- main_cl_db %>% select(-participant_id)

# Transpose the data
main_cl_db_t <- t(main_cl_db_no_id)

#calcualte dissim matrix
jaccard_dist_symptoms <- dist(main_cl_db_t, method = "binary")


##function wrapped with set.seed
setseed_fct <- function(data) {
  jaccard_dist <- dist(data, method = "binary")
  
  set.seed(1)
  
  hc <- hclust(jaccard_dist, method = "complete")
  
  return(hc)
}

# use func
hc_symptoms <- setseed_fct(main_cl_db_t)

# cut tree
grp_symp <- cutree(hc_symptoms, k = 6)
table(grp_symp)

Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức sự kiện 5 sao Thông tin về chúng tôi Dịch vụ sinh nhật bé trai Dịch vụ sinh nhật bé gái Sự kiện trọn gói Các tiết mục giải trí Dịch vụ bổ trợ Tiệc cưới sang trọng Dịch vụ khai trương Tư vấn tổ chức sự kiện Hình ảnh sự kiện Cập nhật tin tức Liên hệ ngay Thuê chú hề chuyên nghiệp Tiệc tất niên cho công ty Trang trí tiệc cuối năm Tiệc tất niên độc đáo Sinh nhật bé Hải Đăng Sinh nhật đáng yêu bé Khánh Vân Sinh nhật sang trọng Bích Ngân Tiệc sinh nhật bé Thanh Trang Dịch vụ ông già Noel Xiếc thú vui nhộn Biểu diễn xiếc quay đĩa Dịch vụ tổ chức tiệc uy tín Khám phá dịch vụ của chúng tôi Tiệc sinh nhật cho bé trai Trang trí tiệc cho bé gái Gói sự kiện chuyên nghiệp Chương trình giải trí hấp dẫn Dịch vụ hỗ trợ sự kiện Trang trí tiệc cưới đẹp Khởi đầu thành công với khai trương Chuyên gia tư vấn sự kiện Xem ảnh các sự kiện đẹp Tin mới về sự kiện Kết nối với đội ngũ chuyên gia Chú hề vui nhộn cho tiệc sinh nhật Ý tưởng tiệc cuối năm Tất niên độc đáo Trang trí tiệc hiện đại Tổ chức sinh nhật cho Hải Đăng Sinh nhật độc quyền Khánh Vân Phong cách tiệc Bích Ngân Trang trí tiệc bé Thanh Trang Thuê dịch vụ ông già Noel chuyên nghiệp Xem xiếc khỉ đặc sắc Xiếc quay đĩa thú vị
Trang chủ Giới thiệu Sinh nhật bé trai Sinh nhật bé gái Tổ chức sự kiện Biểu diễn giải trí Dịch vụ khác Trang trí tiệc cưới Tổ chức khai trương Tư vấn dịch vụ Thư viện ảnh Tin tức - sự kiện Liên hệ Chú hề sinh nhật Trang trí YEAR END PARTY công ty Trang trí tất niên cuối năm Trang trí tất niên xu hướng mới nhất Trang trí sinh nhật bé trai Hải Đăng Trang trí sinh nhật bé Khánh Vân Trang trí sinh nhật Bích Ngân Trang trí sinh nhật bé Thanh Trang Thuê ông già Noel phát quà Biểu diễn xiếc khỉ Xiếc quay đĩa
Thiết kế website Thiết kế website Thiết kế website Cách kháng tài khoản quảng cáo Mua bán Fanpage Facebook Dịch vụ SEO Tổ chức sinh nhật